SAM, открытый как готовое выравнивание

Тёмная тема

Сто пятьдесят ридов PacBio HiFi так, как их положил minimap2, прямо из SAM: файл говорит, где каждый рид, а readhit читает CIGAR. Здесь ничего не выравнивается и не обрезается — показать картину, которой в файле нет, это единственное, чего вьюер делать не должен. Качество риды несут своё, а база Q93 у HiFi настолько надёжна, насколько база вообще бывает.

readhit отображает SAM-файл из 150 ридов PacBio HiFi на референсе 1.6 кб, размещённых по их записям CIGAR, с показаниями по колонке: глубина 77× и база Q93, тёмная тема
><> fishkabio.ru